接近仲夏时分，居住在下东区的一个3岁男孩出现了脑部感染眼镜蛇病毒的症状后死在了贝佛医院内。没有任何征兆表示他是如何受感染的，有可能是他接触到了一些遗留下来的病毒晶体，尽管用化学消毒剂对隧道内进行了数天乃至数周的清洗，但是下东区的地铁隧道内仍有可能有一些病毒残留，现在人们还不清楚病毒晶体能够在黑暗、干燥环境下的空气中生存多久。

奥斯汀从亚特兰大飞到了纽约，她约见了男孩的家属。通过和家属的聊天，她发现死亡三天前男孩在睡觉的时候脚曾经被老鼠咬过。

之后，在9月初，一名无家可归的男子死在了女王区的艾姆赫斯特医院，后来证实他感染了眼镜蛇病毒。他曾经住在罗斯福大街杰克逊高地下面的地铁隧道内。那个废弃的隧道内的空间很大，里面肯定会有老鼠，杰克逊高地下面的隧道和曼哈顿东区隧道通过东河下面的一段隧道连接起来。受病毒感染的老鼠很有可能是从曼哈顿那边过来的。

这个无家可归男子的身体上没有老鼠咬过的痕迹。不过，疾病控制中心的调查人员还是捕获了数十只老鼠并对它们进行了眼镜蛇病毒血液检测，其中一只的检验结果是阳性，这只老鼠已经把背部的大部分毛都拔掉了。它已经从眼镜蛇病毒的感染中挺了过来并且成了病毒的携带者。

疾病控制中心的调查人员检验了从城市的其他地区抓来的更多的老鼠，发现眼镜蛇病毒已经进入了鼠群，老鼠可以携带眼镜蛇病毒而不会死亡，眼镜蛇病毒和老鼠都适应了对方。苏珊首先发现了眼镜蛇病毒可以在啮齿动物体内存活，之后一只白鼠把病毒传染给了她，她在不经意间证明了眼镜蛇病毒可以从啮齿动物传播给人类。实现了病毒在物种之间的传播，一些研究人员认为它们具有填补生态龛位（疾病的栖息地）的趋势。眼镜蛇病毒似乎已经在鼠群中找到了一个龛位。

没有人知道眼镜蛇病毒是如何进入老鼠体内的。有可能是栖息在第二大街地铁隧道内的老鼠在炸弹爆炸的时候感染了病毒，奥斯汀想知道那些在休斯敦大街啃食莱姆的躯体的老鼠是不是最初的传染源。可能没有人会知道这些，不管怎么说，眼镜蛇病毒也都已经进入了地球的生态系统中，没有人能预测出它未来的发展趋势。

尽管从生物学意义上来讲眼镜蛇病毒非常聪明，但是和其他的病毒一样，眼镜蛇病毒没有思维和意识，不过是一个精心设计的能够自我复制的程序而已，它是一个机会主义者，并且它知道如何寻找最佳时机。眼镜蛇病毒已经在老鼠群体中达到了一种平衡状态，由于人类永远不可能根除老鼠，因此它们可以在老鼠体内永远生存下去，眼镜蛇病毒在新的寄主体内不断繁衍后代生存下去，或许会发生基因变异，变化成新的形式或菌株，等待着下一次的爆发时机。